El edificio se encuentra exento y rodeado de un pequeño jardín.

La sección de Arqueología está en la planta baja, mientras que la planta alta está dedicada a las exposiciones permanentes de Bellas Artes.

Las instalaciones del Museo cuentan con dos edificios anexos, realizados por Luis Berges Roldán a partir de 1965 siguiendo la arquitectura popular jiennense.

El situado al oeste del edificio principal, ofreciendo fachada a la calle Cristo Rey, es el edificio administrativo, donde se ubican las oficinas, los laboratorios y los almacenes.

El situado al norte sirve para albergar exposiciones temporales en las plantas baja y primera; en el sótano se ubica la exposición permanente correspondiente a las esculturas de Porcuna, de época ibérica.