Todas estas construcciones fueron cedidas al excelentísimo Ayuntamiento de Ibiza.

En la actualidad, aunque permanece cerrado desde 2011 y no hay visos de una pronta apertura, se ha mantenido la estructura original del edificio adaptándolo a las necesidades museísticas.

El museo se crea en 1907, cuando la Sociedad Arqueológica Ebusitana dona su colección al Estado.

La Sociedad Arqueológica Ebusitana fue fundada en 1903, y entre sus miembros figuran nombres ilustres de la arqueología ebusitana, como Arturo Pérez-Cabrero, Vives Escudero, Joan y Carles Roman o Fidel Fita.

Carles Roman, director del vetusto Museo Arqueológico de Dalt Vila, aprovechó la visita para plantearle al monarca un ambicioso proyecto en la necrópolis de Puig des Molins.

Pero nuevamente la desgracia parecía cernirse sobre este monográfico, se inicia la Guerra Civil.

Eso hizo que la obra, con libramiento previsto para diciembre de 1936, se parará el 19 de julio (día del Alzamiento), cuando sólo se habían levantado las paredes maestras.

Destacan entre sus investigaciones: Sin duda este último trabajo es el que más renombre le proporcionó; además de ser el más conspicuo y necesario para la época, llenando un vacío en la investigación del Mediterráneo Occidental.

Posteriormente en 1968, fue inaugurado definitivamente como Museo Monográfico de Puig des Molins.

El monográfico ha pasado grandes temporadas cerrado y envuelto en múltiples reformas.

La visita se inicia por una sala del antiguo órgano de administración territorial desde la Baja Edad Media y Edad Moderna, la Universitat d'Eivissa, que se ha dividido en dos espacios.