En 1665, Muruzábal obtuvo del rey la calidad de villa y la jurisdicción civil, por 5280 reales que dio al erario, separándose de Valdizarbe, haciéndose definitivo en 1730.

A finales del siglo XVIII la iglesia parroquial estaba servida por un vicario y dos beneficiados; funcionaba en la localidad un molino harinero.

El centro del crucero se cubre con cúpula y linterna sobre pechinas.

Alberga el sepulcro del obispo de Calahorra, Juan Juániz (1666).

La capilla gótica del lado del evangelio alberga un retablo del siglo XV, restaurado, dedicado a San Juan Bautista y San Juan Evangelista, con sus tallas, y el resto de tablas de pintura, con finas cresterías góticas.