Su cabecera es la población de San Francisco Ixhuatán.

Tiene una extensión territorial de 213.344 kilómetros cuadrados que equivalen a 0.235 de la extensión total del estado.

El municipio incluye en su territorio un total de veinte localidades.

El gobierno le corresponde al ayuntamiento, conformado por el presidente municipal, un síndico y el cabildo integrado por cuatro regidores.

Todos son electos mediante voto universal, directo y secreto para un periodo de tres años que pueden ser renovables para un periodo adicional inmediato.