[4] La asociación Mujer & Mujer inició originalmente como parte de la fundación Famivida, organización LGBT creada en 1995 y que fue la primera de su tipo en Guayaquil.[6] El grupo fue creciendo en los años siguientes y llegó hasta las 60 integrantes.En 2005, fueron invitadas al quinto Encuentro Nacional Lésbico, organizado por la fundación quiteña Causana.[8] Debido a discrepancias con dirigentes de Famivida, que habían iniciado al menos desde 2005,[9] las integrantes de Mujer & Mujer decidieron separarse y formar su propia fundación.Las otras organizaciones que se unieron en el proyecto fueron la Alianza Igualitaria, Caballeros Transmasculinos y Diverso Ecuador.
Instalaciones de la fundación Mujer & Mujer, en el centro de
Guayaquil
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