Los suelos son arenosos a franco-arenosos muy erosionados de escasa profundidad, con área pedregosas, ondulados, atravesados por cárcavas que bajan del volcán Concepción.

De la misma manera posee accidentes geográficos sumamente rupestres y pletóricos en riquezas arqueológica.

[1]​ El municipio posee una precipitación anual que varía entre los 1400 y 1600 mm, caracterizándose por una buena distribución durante todo el año.

Su temperatura oscila entre los 27 a 27,5 °C, lo que define al clima de sabana tropical como semi-húmedo.

[2]​ En épocas remotas la flora era abundante, en el Volcán Concepción la vegetación cubría hasta la cúspide, antes de 1880 en que hizo su primera erupción.

La carretera norte conecta moyogalpa con diferente localidades La Concepción, La Flor, San Marcos, Altagracia, etc.