Ambos topónimos, como era lógico en ese momento, son árabes, el segundo, gudur, con el significado de «albercas estanques, lagunas, remansos», y el primero rawda (pronunciado «roda» o رُوّزَة en andalusí), «jardín funerario que puede contener un mausoleo».

Tras los pasos previos a la instalación definitiva de los monjes en Rueda, la actividad constructiva se desarrolla durante todo el siglo XIII en sus ámbitos fundamentales.

En este momento quedó configurado no solo el núcleo medieval que hoy podemos admirar, sino también una serie de dependencias complementarias como la zona de conversos, estancias agrícolas, antiguo palacio del abad, etc.

Varias décadas más tarde, detrás del claustro se construyó la gran nave de los nuevos dormitorios y el noviciado, actualmente en estado semirruinoso.

Consisten en el azud y la noria o rueda que elevaba el agua del río hasta el acueducto de factura gótica, en parte visible y en parte subterráneo, que reparte el agua por el conjunto monástico siguiendo las disposiciones propias de la Orden.

Ya recientemente, las edificaciones postmedievales y la huerta son cedidas por su último propietario a la Diputación General de Aragón, en 1990.

El claustro también sufrió un lento proceso constructivo, siendo más antigua la galería este donde se ordenan la sala capitular, con una portada inigualable y con las tumbas de varios abades; la escalera al dormitorio; el locutorio, desde el que se accede a la cárcel y, a continuación, el paso a la huerta y la sala de los monjes en el ángulo sudeste.

En la galería meridional se encuentra, en primer lugar, el calefactorio, le siguen el refectorio con el pabellón de la fuente o lavatorio enfrentado y la cocina.

Desde el cuerpo barroco superior se obtiene una visión inigualable de todo el conjunto.

Así se configuró el monasterio cisterciense que hoy podemos contemplar como ejemplar único en su traza.