Al comenzar el año 2000, y debido a la crisis financiera que atraviesa el canal y a la salida de los dueños de la Marca Miss Chile, se decidió no realizar el certamen.

Daniella Campos, ganadora de la versión 1998, y Millaray Palma, diseñadora de alta costura, decidieron tomar el desafió y elegir a Miss Mundo Chile resultando ganadora la linarenense Isabel Bawlitza.

Durante los dos últimos años de la organización, se seleccionó a la representante chilena en los reality show No Basta con ser Bella (2012) y Proyecto Miss Chile (2013) transmitidos por Canal 13 en conjunto con la entonces presidenta de Miss Chile, Carla Marín.

[2]​ En 2015 se volvió a enviar una representante, esta vez bajo la franquicia Miss Mundo Chile, organizada por Keno Manzur.

[1]​ La nueva organización está enfocada en tener una causa que represente en su totalidad el lema «Belleza con propósito».