La cardiomiopatía hipertrófica se hereda como un rasgo autosómico dominante y se atribuye a mutaciones en uno de varios genes que codifican a las proteínas del sarcómero, que es la unidad anatómica y funcional de la fibra muscular.

El pronóstico suele ser variable, en función del gen que esté mutado.

Un genotipo creado por deleción, por ejemplo, se asocia con una hipertrofia más pronunciada del ventrículo izquierdo y con un riesgo mayor de efectos patológicos.

[8]​ [9]​ Las miocardiopatías incluyen a cualquier enfermedad primaria del músculo cardíaco.

[11]​ Durante la sístole se crea una zona de baja presión como consecuencia de un acelerado flujo sanguíneo a través de una región más angosta entre el tabique interventricular y las valvas mitrales, causando un efecto Bernoulli, lo cual conlleva a una obstrucción del flujo hacia el exterior del corazón.