En 1990, en ese periodo se le brindó el apelativo de Sport Meteor.

logra empatar frente al Alianza Lima por 2 - 2 y luego lo vence en penales por 6 - 5, por única vez.

Para el siguiente año, Meteor Sport Club pierde la categoría al terminar última posición, de ambos campeonatos regionales.

Para el siguiente periodo Meteor S.C., se independiza del Lawn Tennis y participa en forma individual.

En esa temporada, se une con el Deportivo Junín de Huancayo (adoptando su uniforme).

La campaña no fue mala, ya que logró el cuarta posición de la liga.

La única diferencia es el color azul que reemplaza al negro del Udinese.

Luego en la segunda división, el club enfrentó a los clubes: Unión Huaral, Deportivo Yurimaguas, Guardia Republicana, Alcides Vigo, América Cochahuayco, Bella Esperanza, Deportivo Zúñiga, Sport Agustino, etc., en su lucha por volver a la primera división.