[5]​ En 1975 fue transferido a Independiente, club con el que finalmente ganó la Copa Libertadores anotando un gol en la final[6]​ y con el que ganó la Copa Interamericana del siguiente año.

Ya en sus últimos años, regresaría al país para ser campeón por sexta vez con Universitario en la temporada 1982, siendo incluso el goleador de aquel torneo con 19 anotaciones.

Fue goleador e ídolo crema, conquistando varios campeonatos nacionales, llegando a disputar la final de la Copa Libertadores en 1972.

Es el primer peruano que anotó en una final de Libertadores, en la caída merengue 2-1 contra Independiente.

Ese mismo año convirtió un gol ante Racing, tras apilar a medio equipo rival; tiempo después de retirado no dudó en considerarlo como el mejor gol de su carrera.

[18]​ Luego retorna al Perú en 1977, jugando tres años y medio por Sporting Cristal, donde se convierte en goleador y figura importante junto a Julio César Uribe, Roberto Mosquera entre otros de talla mundial, logrando con el cuadro celeste el campeonato 1979.

En diciembre del 2012 es homenajeado por la Conmebol, recibiendo la medalla de la Orden de Honor al Mérito del Fútbol Sudamericano por el distinguido trabajo que realizó como futbolista con la selección peruana y los clubes en que militó.

[21]​[22]​ Desde hace 25 años, la Escuela de Fútbol Percy Rojas forma valores en niños entre 4 y 15 años, con el fin de brindar la mejor formación deportiva y enseñar los fundamentos básicos del fútbol.

Integró la selección de su país en la Copa América del año 75, donde obtuvo el título.

Felizmente se llegó a un acuerdo con los dirigente y le permitieron jugar medio tiempo de ese partido.

Apagaron las luces del estadio para que ellos llegaran a tiempo y cuando jugó el partido anotó un gol de antología, lo que hoy llamaríamos "maradoniano", dribleó a varios defensas y al portero antes de anotar, por lo que el "Trucha" considera el gol más importante de su carrera.