Los fármacos que no se unen a los receptores producen su correspondiente efecto terapéutico simplemente interactuando con las propiedades químicas o físicas del organismo.Es importante dilucidar el mecanismo de acción de fármacos y medicamentos nuevos por varias razones: Los compuestos bioactivos inducen cambios fenotípicos en las células diana, cambios que son observables al microscopio y que pueden dar una idea del mecanismo de acción del compuesto.[15] Este resulta ser el enfoque más directo para encontrar la proteína diana que se unirá a pequeñas dianas de interés, como una representación básica del esquema de un fármaco, para identificar el farmacóforo del fármaco.[15] Sin embargo, este método también podría usarse para encontrar nuevos objetivos para medicamentos existentes o desarrollados recientemente.Los métodos basados en ómicas utilizan tecnologías ómicas, como quimioproteómica, genética inversa y genómica, transcriptómica y proteómica, para identificar los objetivos potenciales del compuesto de interés.Gracias a la inferencia computacional, es posible formular hipótesis sobre el mecanismo de acción del compuesto, que posteriormente se pueden probar.
