A pesar de no grabar ni una sola canción en sus primeros meses, la banda consiguió gran popularidad en el underground.
Ese año la banda se convirtió en cuarteto al ingresar Erik Nordheim como cantante, pasando a llamarse Messiah (nombre que al igual que el de Aarseth, fue inspirado en una canción de Hellhammer).
Ese mismo año dos miembros dejarían la banda, Maniac, que fue expulsado por su adicción a las drogas y por sus reiterados intentos de suicidio y el baterista Kjetil Manheim que se fue pero conservó una buena relación con los otros miembros.
Se hacía llamar "Dead", un nombre que reflejaba su fascinación por la muerte, la decadencia y la oscuridad.
A mediados del año 1990 participaron en un concierto en Sarpsborg, Noruega en el festival Support for Slayer Magazine (junto a Equinox y Cadáver) en el que Dead tuvo que ser rápidamente ingresado por excesiva pérdida de sangre por cortarse profundamente.
Este concierto sería incluido años más tarde en el bootleg Dawn of the Black Hearts.
En este concierto, la banda empezó a tocar algunas canciones, como «Funeral Fog», «Pagan Fears» y «Freezing Moon», en esta última la letra fue escrita por Dead y relata una experiencia cercana a la muerte que sufrió cuando todavía era un niño.
En la nota de suicidio que dejó, sus últimas palabras fueron Sorry for all the blood (Disculpad toda la sangre).
Al parecer primero intentó cortarse la venas (en las muñecas y en el cuello) para morir desangrado en un bosque cercano, pero como vio que tardaba demasiado en morir volvió a casa y se disparó con la escopeta.
En esa época, la banda permaneció un tiempo parada sin actuar en directo ni grabar nuevos temas.
Al año siguiente fue publicado Live in Leipzig en homenaje a Dead y que está considerado uno de los álbumes más influyentes del black metal.
Esa noche, Vikernes y Snorre Ruch habían viajado desde Bergen hasta al apartamento de Euronymous en Oslo.
En el juicio, Vikernes aseguró que Euronymous había planeado torturarle hasta la muerte y grabarlo con una cinta de vídeo como si fuera una película snuff.
Unos días después Vikernes fue detenido y unos meses más tarde fue condenado a 21 años de prisión por asesinato e incendio premeditado.
A pesar del título, las canciones no tratan sobre el demonio, sino sobre muerte y existencialismo.
El elegido para sustituir a Aarseth es un desconocido guitarrista, Rune Eriksen conocido como Blasphemer.
En noviembre realizan un concierto en Milán que sería publicado como álbum en vivo al año siguiente, Mediolanum Capta Est contando con la colaboración de Attila Csihar en la canción "From the Dark past".
Ordo ad Chao contiene un sonido mucho más crudo que los anteriores álbumes de la banda.
En el verano de 2009, la banda confirmó al músico francés Silmaeth (Vorkreist)[22] como segunda guitarra.
[24] Silmaeth dejó la banda en febrero de 2011, su puesto fue ocupado por Teloch (Morten Bergeton Iversen) que había colaborado con Gorgoroth y Ov Hell.
Algunas bandas que han mencionado a Mayhem como influencia o han hecho covers de sus canciones son: Immortal,[31] Absu,[31] Behemoth,[31] Gorgoroth,[31] Emperor, Limbonic Art,[31] Carpathian Forest,[31] Aura Noir, Dark Funeral,[31] Vader,[31] Ulver, Keep of Kalessin,[31] Dimmu Borgir, 1349,[32] Anaal Nathrakh[33] y Nargaroth.