Matthäus Merian era el hijo mayor del grabador en cobre Matthäus Merian, llamado el Viejo (1593-1650) y su primera esposa María Magdalena, nacida de Bry.

[1]​ Al morir su abuelo Johann Theodor de Bry, su padre se hizo cargo de su editorial en Fráncfort, donde Matthäus el Joven se convirtió en alumno de Joachim von Sandrart.

Desde 1647/48 también estuvo al servicio del general Carl Gustaf Wrangel, a quien retrató varias veces.

Sin embargo, aparte de estas series, la editorial no produjo casi ningún libro.

Merian alcanzó sus mayores éxitos como retratista, por ejemplo, en la coronación de Leopoldo I en Fráncfort en 1658.