En 1985 se incorporó al club austriaco Spittal / Drau, donde permaneció durante tres temporadas.
En general, Kek hizo 280 apariciones con Maribor en todas las competiciones durante once temporadas.
[5] Kek regresó a Maribor como entrenador interino después de que Ivo Šušak renunciara.
En las temporadas 2013-14, 2014-15 y 2015-16 de la Primera Liga croata, Rijeka terminó como subcampeón.
Con más de cinco años en el club, Kek tiene numerosos récords del club, incluida la mayor cantidad de victorias y apariciones para un entrenador.
[21] Dirigió al equipo en las clasificatorias para la Eurocopa 2020, donde terminaron en cuarto lugar con cuatro victorias en diez partidos.
[23] En noviembre de 2023, logró la clasificación a la Eurocopa 2024 después de derrotar a Kazajistán por 2-1 en la última jornada, asegurando la primera aparición del país en el torneo en 24 años.