En 1883 obtiene un doctorado defendiendo la tesis "Los mecanismos protectores empleados por las semillas contra agentes dañinos".
Es cautivado por la ciudad y el área de Table Mountain y arranca inmediatamente a recolectar flora, expedicionando a Klein Winterhoek, "Du Toitskloof", Bainskloof, Sneeukop'.
Durante esa época comienza con su propia farmacia en Ciudad del Cabo.
En esos tiempos "el Cabo" se interpretada como una extensión muy grande del sur de África.
Así para escribir el reporte, Marloth se vio necesitado de extender sus viajes a Cederberg, Gifberg, Koue Bokkeveld, Swartruggens y Rodesia.