El uso de la fortaleza fue sobre todo defensivo y no tanto como residencia para familias reales.

De los 40 castillos existentes entre Bingen am Rhein y Koblenz, Marksburg fue, junto al castillo Maus, los dos únicos que nunca fueron destruidos y el único que ha sido mantenido durante toda su existencia.

[1]​ En el año 1100 los Eppstein, poderosa familia de la región con varios miembros arzobispos de Mainz y Trier,[2]​ levantaron una torre del homenaje que finalmente se extendió hasta convertirse en un castillo en el 1117 aunque su primera mención en documentos data del 1231.

[2]​ Con la disolución en 1806 del Sacro Imperio Romano Germánico a manos de Napoleón, este cedió Marksburg a su aliado el duque de Nassau por sus servicios el cual usó el castillo como prisión y como hogar para soldados retirados.

[6]​ En marzo de 1945 el castillo fue seriamente dañado por la artillería americana desde la orilla opuesta del Rin.