Fue el segundo hijo del capitán Kitsos Botsaris, que fue asesinado en Arta en 1809 bajo las órdenes de Ali Pasha.

Botsaris planeaba capturar a Mustai Pasha como prisionero durante la escaramuza pero fue alcanzado en la cabeza por un disparo y asesinado.

El hermano de Markos, Kostas (Constantine) Botsaris, que también luchó en Karpenisi y completó la victoria, sobrevivió para convertirse en un respetado general y diputado en el reino griego.

Su memoria aún se recuerda en célebres canciones populares de Grecia.

También se escribieron dramas populares y canciones infantiles después de su muerte.

También aparece a menudo en pósteres que adornan clases, oficinas gubernamentales y dependencias militares, como miembro del panteón nacional de héroes griegos.