Se destina principalmente a la producción de aceite de oliva virgen extra.
Es un aceite de picor y amargor más suaves que el de la variedad picual, con un frutado intenso a aceituna verde y extensa gama de aromas.
[3] La IGP Aceites de Jaén recoge en su pliego esta variedad como secundaria y autóctona, amparando la producción y comercialización de aceite procedente de la variedad Manzanillo de Jaén bajo este marchamo.
[4][5][6] Si bien el aceite virgen extra procedente de la variedad secundaria Manzanillo de Jaén no ha solido ser diferenciado, sino que ha servido para dar enriquecer y dar nuevos matices y aromas al aceite virgen extra procedente de la variedad dominante picual (este último mayor al 90% en la mezcla o coupage según el pliego de la DOP Sierra Mágina),[6] desde el año 2014 la cooperativa San Roque de Carchelejo produce el aceite de oliva virgen extra monovarietal Manzanillo de Jaén, bajo la marca «Emblema».
La pérdida de ejemplares y el retroceso en producción de esta variedad, quizá causado debido a su menor rentabilidad, ha impulsado a la Denominación de Origen segureña a buscar nuevas posibilidades para la variedad, ya sea en monovarietal o en coupage, en un mercado actual ávido de productos innovadores, con nuevos aromas y sensaciones.