Hijo de don José Ignacio Eyzaguirre Arechavala y doña María Mercedes Portales y Palazuelos, hermana del ministro Diego Portales.
Estudió Leyes en el Instituto Nacional, del cual se graduó en septiembre de 1843.
Casado en primeras nupcias con Teresa Echeverría y Ruiz-Tagle, sin sucesión.
Al enviudar contrajo segundo matrimonio con Javiera Echaurren y García-Huidobro, con quien si tuvo descendencia, su suegro fue Gregorio de Echaurren Herrera y cuñado de Francisco Echaurren García-Huidobro, Silvestre Ochagavía Errázuriz y del expresidente Federico Errázuriz Zañartu.
[1] Su carrera política la inició en el Partido Conservador, inspirado por los ideales de su tío, el ministro organizador de la República.