El 22 de febrero de 1896 se convirtió en Gobernador del Länder de la Silesia Austriaca, un puesto clave en una región estratégica del Imperio: no solo era un länder rico en recursos naturales sino que también estaba situado en la frontera con los imperios alemán y ruso.

En 1898, el Conde se convirtió en Gobernador y representante del Reichsrat Imperial Austriaco para el Länder de Estiria,[3]​ un puesto de gran importancia que mantuvo hasta la caída del Imperio en 1918.

El 12 de febrero de 1928, el conde Manfred von Clary-und-Aldringen murió en su residencia del Schoss Herrnau (Palacio Herrnau) en Salzburgo.

El Conde Clary und Aldringen es visto ampliamente como un modernizador y ha sido considerado tanto uno de los más prominentes estadistas del fin del Imperio austriaco como un símbolo de la influencia de la alta nobleza austrohúngara en la política en el final del siglo XIX.

También ha sido conocido por su exitosa lucha contra la tuberculosis cuando era Presidente de la Cruz Roja austriaca en el Kronland.