Además fue presidente del Instituto para la Diversificación y Ahorro de Energía (IDAE), del Instituto Tecnológico Geominero de España y del Centro de Investigaciones Energéticas, Medioambientales y Tecnológicas (CIEMAT).
Durante su mandato llevó a cabo una importante reestructuración del Departamento de encabezaba, puesto que el marco europeo y autonómico había dejado a muchos organismos estatales fuera de juego.
Así, por ejemplo, suprimió el Fondo de Ordenación y Regulación de Producciones y Precios Agrarios (FORPPA) y el Servicio Nacional de Productos Agrarios (SENPA), creando en su lugar el Fondo Español de Garantía Agraria (FEGA), y el Instituto para la Conservación de la Naturaleza (ICONA) y el Instituto Nacional de Reforma y Desarrollo Agrario (IRYDA), reemplazando estos últimos por el Organismo Autónomo Parques Nacionales (OAPN).
[1] Desde 1996 hasta 2004 ha trabajado como consultor en asuntos energéticos y ha sido presidente de la Fundación Doñana 21, cargo que ocupó hasta noviembre de 2008.
Desde el año 2007 hasta 2012 fue consejero de Redes Energéticas Nacionais (REN).