Tras dos campañas con la afición enfrentada entre uno y otro equipo José Ros Mayor consigue convencer a ambas directivas que lo mejor es fusionar ambos clubes en uno sólo.
En su primera temporada consiguió el ascenso a Tercera División siendo campeones con la cifra récord de 101 puntos.
Tras la temporada varios de los mejores jugadores abandonan el club y en la siguiente (1998/99) casi desciende a Preferente.
Tras eliminar al CD Eldense en semifinales perdió con el CE L'Hospitalet los dos partidos de la final.
[7] En 2010 el Lorca Deportiva atravesó una grave situación económica por la cual su dueño no lo inscribió al equipo en Tercera División y nadie pudo asumir su deuda, por lo cual el empresario Cristóbal Sánchez Arcas registró el Lorca Atlético Club de Fútbol.
Tras no fructificar las negociaciones con el Caravaca[8] ni con el Jumilla[9] llegó a un acuerdo para comprar y trasladar el Sangonera Atlético.
[14] El primer partido, amistoso, se disputó el 12 de agosto en Pulpí contra el Atlético Pulpileño.
El centrocampista Roberto Casabella anotó el primer gol de la historia del equipo lorquino.
[15] El 15 de agosto ganó el tradicional Trofeo Playa y Sol al Águilas FC por 1-2.
[19] Pese a ello la asistencia al estadio era muy baja, no siendo suficiente ni para pagar los costes arbitrales en la mayoría de los partidos.
Tras la victoria contra el Real Murcia en Lorca el equipo sólo ganó tres partidos de diecinueve.
Tras perder contra el Real Murcia en Nueva Condomina cayó a puestos de descenso.
[24][25] Tras barajar varios nombres el presidente decide dar el mando al trío formado por Joaquín Arregui (segundo de Benigno), Alonso Parra (preparador físico) y Sergio Embarre (director deportivo).
[32] Comienza a rumorearse la desaparición del club al interponer los jugadores sus denuncias en la AFE y no poder siquiera contactar con el presidente para cobrar.
El Lorca Atlético contaba con un filial en Segunda Autonómica, fundado en 2011 con la idea de suministrar jugadores al primer equipo.