Crece en áreas húmedas de valles profundos, en contrastes con Lobelia telekii que crece de forma similar en hábitat secos.
Lobelia deckenii produce a menudo múltiples rosetas.
[1] La planta Lobelia deckenii consiste entre una y ocho rosetas, todas conectadas bajo tierra.
Lobelia deckenii es la única especie que vive en el Kilimanjaro.
y publicado en Flora of Tropical Africa 3: 466.