La siguiente es la lista de las universidades públicas y privadas del Perú licenciadas por la SUNEDU.
También se enumeran centros educativos con rango universitario como institutos y escuelas superiores.
Hubo dos universidades reales y pontificias que se extinguieron y esas son la Pontificia Universidad de San Ildefonso y la Pontificia Universidad de San Ignacio de Loyola del Cusco.
En los últimos años se ha generalizado el uso de rankings universitarios internacionales para evaluar el desempeño de las universidades a nivel nacional y mundial; siendo estos rankings clasificaciones académicas que ubican a las instituciones de acuerdo a una metodología científica de tipo bibliométrica que incluye criterios objetivos medibles y reproducibles, tomando en cuenta por ejemplo: la reputación académica, la reputación de empleabilidad para los egresantes, la citas de investigación a sus repositorios y su impacto en la web.
Del total de 92 universidades licenciadas en el Perú,[9] la Universidad Nacional Mayor de San Marcos, la Universidad Peruana Cayetano Heredia, y la Pontificia Universidad Católica del Perú, son hasta la fecha las tres únicas universidades peruanas que han llegando a ocupar la primera posición a nivel nacional en diversas ediciones de las clasificaciones académicas existentes.