Tradicionalmente se consideró que formaban una grupo filogenético válido dentro de la familia austroasiática, aunque esa hipótesis ha sido cuestionada.

Posteriormente se propuso que las lenguas austroasiáticas constan realmente de tres ramas: mon-jemer nuclear, munda y jasi-jmui.

El grupo mon-jemer tradicional constituyen una agrupación convencional de las familia austroasiática, aunque en otro tiempo se consideró que formaban una rama unidad filogenética dentro de esa familia.

Sin embargo diversos autores proponen que realmente el grupo mon-jemer en sí mismo no es una rama sino que agrupa a varias ramas de la familia austroasiática.

El siguiente cuadro incluye algunas vocales frecuentes (AFI) y la ortografía convencional usada para diferenciar estas vocales: Sidwell (2005) reconstruyó el siguiente inventario consonántico del proto-Mon-jemer: Este sistema es idéntico a reconstrucciones anteriores, excepto por el fonema *ʄ, que ha sido preservado razonablemente bien en las Katuico.