El pueblo de La Joya se encuentra a una altitud de 3.736 m en la margen derecha del río Desaguadero, que conecta el lago Titicaca por el norte con el lago Poopó por el sur en el altiplano boliviano.

La Joya se encuentra en el Altiplano boliviano entre las cadenas montañosas andinas de la Cordillera Occidental al oeste y la Cordillera Central al este.

La región tiene un clima diurno pronunciado, las temperaturas medias mensuales varían sólo ligeramente entre 6 °C en junio/julio y 13–14 °C en noviembre/diciembre.

La Joya se encuentra a 54 kilómetros por carretera al noroeste de la ciudad de Oruro, capital del departamento del mismo nombre.

El camino conduce en línea recta a La Joya después de cinco kilómetros, mientras que un camino sin salida de tres kilómetros se bifurca justo después del puente en dirección sur hacia el pueblo vecino de Chuquiña .