En particular, se distinguió en Šabac en 1790, cuando dirigió a sus tropas al asalto de la fortaleza en el río Sava.

Estaba posicionado en puntos clave para proteger los movimientos del ejército austríaco.

Por su acción en Šabac, fue elogiado personalmente por el Emperador; al día siguiente, fue ascendido a mayor y se le dio el mando de un batallón de granaderos.

Amenazaron con consecuencias ambiguas, pero bastante graves, si algo le sucedía a la familia real.

Estaba posicionado en Brisgovia, un territorio de los Habsburgo entre la Selva Negra y el Rin.

Durante estos ataques, perdió todo el terreno que había ganado en los días anteriores.

Fürstenberg mantuvo Kenzingen, 4 km al norte de Riegel en el río Elz.

Karl Aloys zu Fürstenberg recibió la orden de fintar contra Riegel, para proteger las principales posiciones austriacas en Rust y Kappel.

Francisco II, el emperador del Sacro Imperio Romano Germánico, lo nombró coronel y propietario del 36.º Regimiento de Infantería, que llevó su nombre hasta su muerte en batalla en 1799.

Austria se retiró de aquellos territorios por los que el ejército había luchado duramente, incluidos los cruces de ríos estratégicos en Huningue y Kehl, así como ciudades clave más al norte.

Más tarde, en 1797, viajó a Praga y permaneció con su familia hasta mayo de 1798, cuando recibió un puesto en una nueva división en Linz.

Un levantamiento republicano en los cantones suizos, alentado por la República Francesa que ofreció apoyo militar, condujo al derrocamiento de la Confederación Suiza y al establecimiento de la República Helvética.

Al cruzar el Rin a principios de marzo, Jourdan actuó antes de que el ejército del archiduque Carlos pudiera ser reforzado por los aliados rusos de Austria, quienes habían acordado enviar 60.000 soldados experimentados y su comandante más experimentado, el generalísimo Alexander Suvorov.

Además, si los franceses tenían los pasos interiores en Suiza, no solo podrían evitar que los austríacos transfirieran tropas entre el norte de Italia y el suroeste de Alemania, sino que podrían usar las rutas para mover sus propias fuerzas entre los dos escenarios.

[18]​ La vanguardia francesa llegó a Ostrach entre el 8 y 9 de marzo y durante la semana siguiente se enfrentó a los puestos avanzados austriacos, mientras llegaba el resto del ejército francés.

Jourdan esperaba que las tropas de Dominique Vandamme llegaran a tiempo para apoyar su flanco norte cerca del río, pero Vandamme había ido a Stuttgart para investigar, pues había rumores de que había presencia de tropas austriacas allí, haciendo que no se reincorpore al ejército principal.

Jourdan pensó que tenía más tiempo, esperando que Carlos necesitaría todavía tres o cuatro días para mover sus tropas a través del Lech y marchar a Ostrach, pero a mediados de la Semana Santa de 1799, más de un tercio del ejército de Carlos, 48.000 tropas, se colocó en una formación paralela a Jourdan, y sus 72.000 tropas restantes se alinearon con el ala izquierda en Kempten, el centro cerca de Memmingen, y el flanco derecho se extendió hasta Ulm.

Fürstenberg cubrió el flanco norte de la fuerza principal del Archiduque.

En la mañana del día en el que se pensaba que se daría el enfrentamiento general, Karl Aloys zu Fürstenberg buscó al capellán de campo y solicitó los sacramentos porque, como le dijo a su ayudante, cualquier cosa puede suceder durante una batalla.

Aunque Ostrach había sido una batalla reñida, en Engen y Stockach, las fuerzas austríacas y francesas estaban mucho más concentradas (más hombres en un espacio más pequeño) que en Ostrach, donde las fuerzas francesas, en particular, se habían estirado en una larga y fina línea desde el lago de Constanza hasta el norte del Danubio.

[19]​ A la derecha francesa, los cuerpos de Souham y Ferino se encontraron con una fuerte resistencia y fueron detenidos; a la izquierda francesa, las tropas de Lefebvre cargaron con tal fuerza que los austriacos fueron rechazados.

[10]​ Como el asalto de Souham en el centro se había estancado, Carlos todavía tenía suficientes hombres para disponer a parte de su fuerzas a luchar contra esta nueva amenaza, pero los austriacos estaban siendo fuertemente presionados.

Según los informes, Fürstenberg dijo que, mientras él viviera, no dejaría su puesto (a la cabeza de los granaderos) y que el Archiduque no debería desmontar y luchar.

[23]​ El primer príncipe tuvo tres hijos, Joseph Wenzel Johann Nepomuk (1728-1783), Karl Borromäus Egon (1729-1787) y Prosper Maria, que murió en la infancia.

El último hijo de Joseph Wilhelm Ernst murió en 1803 sin descendencia masculina.

En consecuencia, el título volvió a los primogénitos descendientes varones de Karl Aloys zu Fürstenberg.

Karl Egon, como hijo superviviente, heredó el título de Príncipe de Fürstenberg; él y su hermana mayor vivieron hasta la edad adulta y produjeron familias.