El eslogan de la temporada es "¡Ve más allá del espacio-tiempo!"

En un esfuerzo por acabar con su tiranía los luchadores de la resistencia envían a su guerrero más fuerte, Kamen Rider Geiz, al pasado para evitar el nacimiento del Rey Demonio.

Sin embargo, del mismo futuro de Geiz vienen Tsukuyomi, una chica que cree que el destino de Sōgo es diferente, y Woz, un vidente interesado en Sōgo que solo desea ser testigo de las decisiones del muchacho y sus respectivas consecuencias, Tsukoyomi y Woz le dan a Sōgo el Time Driver, con el cual puede transformarse en Kamen Rider Zi-O.

Además de la amenaza del Rey Demonio, el grupo conocido como los Time Jackers también planean dominar el mundo creando los "Another Riders", versiones distorsionadas de los Riders Legendarios.

Así pues, es la misión de Sōgo transformarse en Kamen Rider Zi-O y viajar a las diferentes líneas temporales de los Riders para evitar la distorsión mientras hace frente a la amenaza de convertirse en el Rey Demonio.