Japón ha entrado en una nueva era de innovaciones tecnológicas a medida que Hiden Intelligence, la compañía líder en investigación de inteligencia artificial, desarrolla los HumaGear.
Androides cibernéticos que se han convertido en un elemento básico tanto en la vida pública como en la privada.
En un esfuerzo por combatir esto, el gobierno ha establecido el Escuadrón Militar de Inteligencia Artificial, o A.I.M.S., para destruir estos HumaGears hackeados.
De aquí en adelante, se inicia una guerra explosiva entre Aruto, MetsubouJinrai.NET y A.I.M.S.
Cada episodio de Zero-One incluye en su título un pronombre escrito en katakana.