Nacido probablemente en Salamanca, pasó al Perú junto al licenciado Pedro de la Gasca, participando en las campañas sobre el rebelde Gonzalo Pizarro.
En la relación que Juan Álvarez Maldonado escribió cuando volvió al Cusco, llamada "Relación de la Jornada y descubrimiento del Río Manu" (1572), se describe la rica tierra del Paititi: En marzo de 1572, nuevamente emprendió la exploración de Manopampa, tierra del cacique Mampio, descubriendo un río al que llamó Lázaro, a catorce leguas de la provincia de los Andes.
Se desempeñó como maestre de campo en las acciones de Vitcos y Vilcabamba, y condujo prisionero a Túpac Amaru I en su entrada al Cuzco.
Radicado definitivamente en la Ciudad Imperial, obtuvo las encomiendas de Layosupa, Hatuncolla y Huaro.
Se casó en Arequipa con la dama criolla Ana Cornejo, hija del conquistador Miguel Cornejo, fundador y alcalde ordinario de dicha villa, con la cual tuvo los siguientes hijos: