Es hijo del historiador peruano José Agustín de la Puente Candamo y de Hildegard Brunke Ríos.

Es, asimismo, bisnieto de Manuel Cándamo Iriarte, quien fuese dos veces presidente del Perú.

[3]​ Fue dos veces director del Instituto Riva Agüero en el período 2011-2017.

Sus investigaciones están referidas a la historia social y política del Perú virreinal y a la historia del derecho indiano.

[11]​ Ha sido investigador afiliado al David Rockerfeller Center for Latin American Studies (Universidad de Harvard), y fellow de la John Carter Brown Library (Universidad de Brown).