Al morir Fruto Chamorro el 12 de marzo de 1855 la Asamblea Constituyente le autorizó a continuar en el cargo y luego con sólo 14 diputados se reúne y el 10 de abril del mismo año le elige presidente provisional.

No obstante, el general Ponciano Corral Acosta de facto cumplió su aspiración presidencial, pero tuvo que entregar el poder a Estrada, quien fue confirmado Presidente provisional.

William Walker[3]​ toma Granada el 13 de octubre y el día 23 firma el "Acuerdo de Paz" con el general Ponciano Corral como máximo jefe militar legitimista, acuerdo que instala a Patricio Rivas como Presidente provisorio.

El Presidente Estrada lanza una protesta y se exilia voluntariamente en Honduras.

En 1856 todos los gobiernos centroamericanos ven a Walker como una gran amenaza.