Fue el primogénito de cinco hermanos nacidos en el hogar de don Juan Pablo Pérez Arbizu Rubla y Beaumont y de Rita Martínez Ferreiro.
Llegó a Santa Fe de Antioquia acompañado de su hermano Tomás y contrajo matrimonio con una hija del alférez real y alcalde ordinario de la ciudad, don Bernardo Martínez y Perrúa y de Francisca Ferreiro Pérez.
Se radicó en Santafé donde instaló un reconocido establecimiento de comercio.
Arrubla se había casado el 10 de julio de 1803 en Santafé con María Ignacia Díaz de Herrera y Gálvez, hija del español Juan Díaz de Herrera y Mathei y de Manuela Gálvez Larreátegui.
Fue su u´nico hijo don Gerardo Arrubla Herrera.