Se había manifestado contrario a Rosas y formó con otras provincias la Coalición del Norte para hacerle frente.
La provincia fue más tarde invadida por tropas rosistas al mando de Mariano Maza y el 20 de enero de 1841 Cubas delegó el mando en el unitario Marcelino Augier.
Éste resistió a la invasión y se enfrentó con Maza en el Combate de Amadores, que terminó en una decisiva victoria rosista.
Augier huyó a Tucumán a caballo y Maza nombró el 10 de abril gobernador provisorio al general Juan Eusebio Balboa.
Su cabeza fue exhibida al público como escarmiento.