Zeledon comenzó coleccionando pájaros locales, y los especímenes eran luego enviados a Jean Cabanis, del Museo de Berlín.

Fue allí donde inició una amistad que duraría toda la vida con Robert Ridgway.

En 1872 regresó a Costa Rica como zoólogo de la expedición dirigida por William More Gabb.

La colección es la principal contribución de Zeledon a la ornitología: contenía muchas especies nuevas, en su mayoría descriptas por otros.

También se destacó por asistir a otros ornitólogos durante sus excursiones en Costa Rica.