Allí consiguió una Premier League (siendo el primer español en conseguirlo), una Community Shield en 2004 y una FA Cup en 2005.
Relevó en el once titular de los gunners al veterano jugador neerlandés Dennis Bergkamp.
A pesar de que la temporada siguiente consiguió la Community Shield y, al finalizar la misma, la FA Cup, su adaptación a Inglaterra fue difícil[5] y su influencia en el club londinense fue mermando hasta desaparecer de la alineación titular.
En 2006 el Real Madrid consiguió su cesión por un año a cambio de Júlio Baptista, que igualmente se fue cedido al Arsenal.
[6] En el Real Madrid, Reyes no tuvo demasiadas oportunidades de demostrar su talento.
[9] Allí, dirigido por Quique Sánchez Flores realizó una buena temporada y consiguió la Copa de la Liga.
Al finalizar la temporada, el club portugués quiso hacer efectiva la opción de compra pero, finalmente, Reyes regresó a la disciplina del Atlético de Madrid al no llegarse a un acuerdo entre las tres partes.
Finalmente la oferta fue rechazada y el jugador anunció que no se iba a mover del Atleti.
El partido finalizó con una victoria de su equipo por tres a dos frente al Levante.
El Sevilla F. C. acabó a mitad de la tabla por lo que no consiguió clasificarse para jugar competición europea.
La temporada siguiente fue la primera que Reyes comenzaba en el Sevilla desde hacía 10 años.
Las lesiones sufridas le impidieron coger un ritmo constante de juego y su importancia en el club sevillano se vio reducida.
En la Liga disputó 21 encuentros y el club acabó la temporada en quinta posición.
De esta forma, cuatro años después, Reyes consiguió un nuevo título, su segunda Europa League.
En la temporada siguiente, el Sevilla volvió a disputar la final, esta vez frente al Dnipro Dnipropetrovsk.
Aunque no fue culpa suya, durante su etapa en la selección en 2004 se vio envuelto en una agria polémica cuando el seleccionador Luis Aragonés se dirigió a él con ánimo de motivarle de una manera poco ortodoxa.
Aragonés, en tono elevado le dijo: «Dígale al negro: ¡Soy mejor que usted!»,[20] refiriéndose a su compañero en el Arsenal, Thierry Henry.