Jonathan López nació futbolísticamente en el Club Atlético Independiente de Villa del Rosario, donde desde pequeño se destacaba del resto de sus compañeros por sus sobrantes habilidades técnicas.
En Atlético Rafaela debutó profesionalmente en el año 2006 de la Primera "B" Nacional .
Lopez fue transferido en el 2010 mandado a préstamo por un año con una opción de compra al Peñarol.
Debutó oficialmente en dicho equipo el 20 de noviembre en un encuentro contra Defensor Sporting en el cual arrancó de suplente y pudo jugar los últimos 10 minutos.
Actualmente forma parte de la plantilla titular del Club Atlético independiente de Chivilcoy siendo el delantero referente del equipo.