Walther era primo por el lado materno de Johann Sebastian Bach.
Walther es más conocido por ser el escritor del Musicalisches Lexicon publicado en Leipzig en 1732, que es considerada la primera enciclopedia de música.
El libro es un enorme diccionario de términos musicales y biografías cortas de compositores e intérpretes, que abarca hasta el comienzo del siglo XVIII.
En total el Musicalisches Lexicon define más de 3.000 términos musicales.
Como compositor, Walther ganó fama por sus transcripciones al órgano de obras contemporáneas de compositores italianos y alemanes, como Albinoni, Torelli, Vivaldi y Telemann.