Desde el 2000, The Jim Henson Company tiene su sede en Jim Henson Company Lot, el histórico antiguo estudio de cine de Charlie Chaplin, en Hollywood.
Henson ha producido muchas series de televisión de éxito, como The Muppet Show (1976-1981), Fraggle Rock (1983-1987) y Bear in the Big Blue House (1997-2006); además, la compañía diseñó los personajes de los Muppets para Barrio Sésamo (1969-presente).
Posteriormente, el control de la empresa fue asumido por los hijos de Henson: Lisa, Cheryl, Brian, John y Heather Henson.
En 2000, Henson fue vendido a la empresa de medios alemana EM.TV & Merchandising AG; Sin embargo, a fines de ese año, las acciones de EM.TV colapsaron y la familia Henson volvió a adquirir la empresa en 2003.
En 2004, Henson vendió The Muppets y las marcas comerciales asociadas, así como la serie Bear in the Big Blue House a Disney, pero conserva el resto de los otros personajes, la biblioteca de programas y los activos.