La organización fue fundada en 1987 y abrió sus puertas en el Time Warner Center en octubre de 2004.

Wynton Marsalis es el director artístico y líder de la Jazz at Lincoln Center Orchestra.

El centro también presenta programas educativos en sus edificios, en línea y en escuelas de todo el país.

[5]​ Marsalis dirige también la Jazz at Lincoln Center Orchestra, que se presenta en el Appel Room y en el Rose Theatre además de hacer extensas giras internacionales.

Músicos profesionales visitan las escuelas a través del programa Let Freedom Swing.