Posee varias publicaciones académicas en revistas nacionales e internacionales sobre los temas de justicia y seguridad.[9] Asimismo, ha realizado varias consultorías internacionales para Programa de Naciones Unidas para el Desarrollo (PNUD) y Banco Interamericano de Desarrollo (BID) en países como Panamá, El Salvador, Uruguay, Guatemala, Honduras, y México.[9] Está casada con Eugenio Ortega Frei, hijo de los políticos Carmen Frei y Eugenio Ortega, y quien fuera gerente de asuntos corporativos en la empresa minera canadiense Barrick Gold.[11][12] En 2010 fue designada directora ejecutiva de la Fundación Paz Ciudadana.[13] En ese rol integró una serie de Consejos gubernamentales entre los años 2010 y 2013.[22] También recibió el premio Energía de Mujer, 2016, entregado por Enersis.[24][25][26] Su designación como consejera del Consejo de Defensa del Estado (CDE) causó controversia debido a su rol en el gobierno de la presidenta Bachelet.La presidenta Bachelet enfrentó las críticas, afirmando que «la calificación profesional de Javiera Blanco va a ser un aporte a la labor del consejo», y que los consejeros «se inhabilitan» ante conflictos de interés o responsabilidades propias en los casos en los que participa el CDE.