La temporada 1988-1989 de la Japan Soccer League fue el vigésimo cuarto campeonato de Primera División del fútbol japonés organizado por la Japan Soccer League.
El campeón fue el Nissan Motors, por primera vez en su historia.
Esta fue la temporada pasada en el que se impugnó el segundo nivel en un formato de Oriente y Occidente.
Toshiba ganó un campeonato en segundo lugar, pero esta vez su promoción es automática.
Regional de trajes Fujieda Municipal y NTT Kansai regresaron a sus ligas regionales.