El Gobierno francés no considera este manifiesto como una muestra real del descontento de los marroquíes ante los Gobiernos del Protectorado, y no tiene en cuenta las peticiones que el Partido Istiqlal les hace.De esta forma el partido tiene que reorganizarse en 1945 una vez se liberan estos presos.El rey Mohammed V le hará este encargo al PI debido a los éxitos en política exterior de Balafrej y, por lo tanto, del Istiqlal.Tal es el revuelo, que Mohammed V decide crear una monarquía constitucional fundada en los principios del islam y establecer una constitución.En muy poco tiempo su hijo Hassan II asume el poder y comienza su reinado, que durará hasta 1999.El Istiqlal multiplicó las concesiones y los compromisos de Hassan II, a quien permitieron asumir rápidamente un poder casi absoluto.En junio de 1961 Hassan II redacta una “Ley fundamental” que funcionará como Constitución provisional del país.Los primeros años de esta oposición forzada del Partido Istiqlal fueron conflictivos, ya que el partido se opuso públicamente a los Gobiernos que fueron elegidos en las primeras elecciones legislativas y mostró abiertamente dudas sobre la legitimidad de los resultados electorales.En este momento Allal el Fassi vuelve a oponerse públicamente al monarca.Después de la Marcha Verde en el Sáhara, al Rey Hassan II le interesa tener cerca al Istiqlal por lo que comienza a establecer conversaciones con ellos e incluso llega a darle algunas carteras ministeriales.En 1977 tras unas nuevas elecciones fraudulentas en las que vuelven a ganar los simpatizantes de Hassan II, los miembros del Istiqlal representados por Bucetta y otros partidos como la USFP (Unión Socialista de Fuerzas Populares) muestran su descontento.En 1979 tras ciertos éxitos del Polisario en el ámbito internacional y aludiendo a que ciertos países africanos como Malí no estaban siendo imparciales, Bucetta decide no acudir al comité de sabios de la OUA (Organización para la Unidad Africana).Decisión que rápidamente le reprochan el resto de los países africanos y la USFP.Aceptan, aunque muestran a la opinión pública estar en desacuerdo con la decisión del Rey.Las elecciones municipales de 1983 y las legislativas de 1984 suponen un duro golpe para el Istiqlal que pensaba que había vuelto a entrar en el juego del Gobierno, y sin embargo no fue así, debido a que el Rey creó un partido administrativo: la Unión Constitucional para enfrentarlo al Istiqlal.La oposición, formada por el Partido Istiqlal, la Unión Socialista de Fuerzas Populares, el Partido del Progreso y el Socialismo y la OADP se proponen acabar con la apatía política que reina en esta época y se unen para crear un programa de salvación nacional, pero, aunque parece que se va a llevar a cabo y los líderes de los diferentes partidos parecen estar de acuerdo, esta propuesta se queda sin concluir.En las elecciones legislativas de 1993 el Istiqlal y la USFP deciden presentarse juntos como un solo bloque.Aunque, en unas primeras elecciones, parece que tanto la USFP como el Istiqlal van a tener un papel importante en la formación de Gobierno, tres meses después de esta votación se realiza otra votación en la que los grupos tradicionales de la oposición como el Istiqlal, vuelven a la oposición y no participan en el Gobierno.En 1998 tiene lugar el primer Gobierno real de la alternancia, dirigido por Abderramán Yusufi, miembro del USFP.En estas elecciones la USFP y el Istiqlal vuelven a presentarse como grupos separados.Su líder, Abbas el Fassi, no tenía una aceptación completa por parte de sus compañeros.Como todos los firmantes del manifiesto de independencia, Balafrej es detenido y entra en prisión en el año 1944.Permanece en prisión hasta 1946 y, una vez que sale de la cárcel, se ve obligado a abandonar el país.Tras dejar las riendas del PI en 1974, Allal el Fassi muere en mayo de ese mismo año en Rumanía.En 1944 entra en prisión por firmar el manifiesto de independencia, y permanece en la cárcel 21 meses.En 1951 vuelve a entrar en prisión y no saldrá de ella hasta 1954, cuando asumirá la dirección efectiva del Istiqlal.Meses más tarde también abandonará el cargo de presidente del Istiqlal para ser sucedido por Abdelhamid Chabat.Comienza su etapa de líder del Istiqlal en 2012, tras vencer a su rival Abdelouahed el Fassi.Contra toda expectativa Baraka ha decidido desde que está a cargo del Istiqlal establecer el mismo el contacto con las personalidades del Istiqlal en vez de dejarlo en manos de otros.Todo ello siguiendo la línea ideológica marcada en el Congreso General Elige la comisión de arbitraje y la comisión financiera Elige a los miembros del Comité Central Elige en su última sesión ordinaria la comisión encargada de preparar el Congreso Nacional.Elige al Secretario General Define la política del Partido Define el programa del Partido, sus estatutos, su sistema y su presupuesto.Además de los organismos centrales, el Partido Istiqlal marroquí está organizado a través de organismos locales, provinciales y regionales.