El edificio fue restaurado según su planta antigua por el arquitecto e historiador Emilio Harth-Terré, quien sostiene que el doble claustro del antiguo colegio colonial—uno cuadrado y el otro circular— es único en América del Sur y que en la misma España esa planimetría es bien singular.
Al centro del claustro circular se mantiene una pila de piedra.
[5] Al inaugurarse el Mercedes Cabello, los dos claustros fueron habilitados como patios de colegio y la iglesia como auditorio.
Desde su fundación, el Mercedes Cabello ha tenido un rol protagónico en el desarrollo de la educación pública del Perú y ha logrado innumerables premios en diferentes disciplinas, especialmente deportivas.
[6] Pero debido a que ocupaba un monumento histórico situado en el área intangible del Centro Histórico de Lima, se optó, previa consulta con los padres de familia, alumnos y docentes, trasladar el plantel a una sede más amplia y segura.