Distribuyeron armas y prepararon listas de personas que debían ser eliminadas.
Tras la muerte del presidente Juvénal Habyarimana en abril de 1994 y el inicio del genocidio, soldados bajo el mando de Sagahuto asaltaron y asesinaron al entonces primer ministro Agathe Uwilingiyimana, a varios de los principales líderes de la oposición, y asesinaron a diez soldados belgas que estaban protegiendo al Primer ministro.
Fue arrestado mientras "salía de su hogar en bicicleta, yendo a comprar en un supermercado cercano.
[5] En 2017 fue detenido por intentar cruzar la frontera hacia Burundi, alegando que tenía familiares allí.
Sagahutu aseguró tener documentos que autorizaban su salida de Tanzania, y que había viajado previamente a Mozambique pero esto fue refutado y fue liberado el 1 de mayo.