Un ingeniero de ecosistemas es un organismo que crea, modifica, mantiene o destruye un hábitat.
El castor es el ejemplo típico; en el proceso de cortar árboles y construir diques, cambia el ecosistema en medida considerable.
[6] No solo los animales, sino también otros organismos como hongos pueden ser ingenieros de ecosisitemas.
El mejillón cebra es otra especie invasora que ha modificado los hábitats donde se ha difundido en los ríos de Norte América.
Éste también induce el crecimiento de algas al permitir que la luz penetre más profundamente en el agua.