La iglesia original fue construida en la segunda mitad del siglo XVI, y tomó el nombre de Santa Maria della Pietà, por la imagen que se conserva sobre el portal.

La iglesia y los edificios anexos, situados entre Piazza Colonna y Piazza di Pietra, fueron cedidos por el Papa Benedicto XIII a la Arciconfraternita dei Bergamaschi, que había tenido que abandonar su sede en San Macuto, adscrita al Collegio Romano.

Fue en esta ocasión que la iglesia recibió el nombre de los patrones Bartolomeo y Alessandro.

Fue el canónigo Giovanni Giacomo Tasso, tío del poeta Torquato Tasso,[1]​ quien fundó la compañía religiosa Venerable Archicofradía de los Santos Bartolomé y Alejandro de la Nación Bergamasca, convirtiéndose más tarde en la Archicofradía de los Bergamascos en Roma.

[2]​ El adyacente Ospedale dei Pazzarelli, donde Torquato Tasso fue hospitalizado entre finales de 1589 y principios de 1590,[3]​ fue trasladado en 1725 a via della Lungara, en el Lungotevere.