[4]​ Dos años después, en 1523 Cortés regresa a la ciudad y se establece en Tlaltenango, donde construye una finca.

[6]​[5]​ En sus orígenes la capilla fue dedicada al Señor de la Misericordia, era un adoratorio privado para la familia de los hacendados y posteriormente pasó a ser la capilla para los trabajadores del ingenio y se dedicó a San José.

Los viajeros cargaban consigo un arcón asegurado con bisagras y cerrojos.

[5]​[3]​ En el atrio del santuario hay un mural hecho por el artista Roberto Martínez, develado en 1982 por el obispo Sergio Méndez Arceo.

[5]​ Durante la Revolución Mexicana, la Iglesia de Tlaltenango fue usada como cuartel del ejército zapatista.

Dos años después, las tropas carrancistas tomaron el estado de Morelos y robaron dicha corona.

Cada año se celebra una feria en honor a la virgen desde el 30 de agosto cuando se empieza un novenario que acaba el 8 de septiembre y la feria acaba el 12.