Está dedicada al padre de San Juan Bautista, el sacerdote Zacarías, cuyo cuerpo supuestamente contiene.La iglesia estaba vinculada a un monasterio benedictino, que era visitado por el dogo anualmente en Pascua en una ceremonia que incluía la presentación del cornu (sombrero ducal).Antonio Gambello fue el arquitecto principal, pero la fachada fue acabada por Mauro Codussi.Las paredes de las naves laterales están enteramente cubiertas por pinturas de Tintoretto, Angelo Trevisani, Giuseppe Salviati, Giovanni Bellini (La Virgen y el Niño con santos), Antonio Balestra, Giovanni Domenico Tiepolo, Palma el Viejo y Van Dyck.El artista Alessandro Vittoria está enterrado en la iglesia, marcándose su tumba con un autorretrato en busto.